Das mit Spannung erwartete Add-on Command & Conquer Alarmstufe Rot 3: Der Aufstand ist ab sofort im EA Store und bei anderen digitalen Anbietern als Download verfügbar. Außerdem wird das Spiel ab dem 02. April 2009 als „Code in a Box“-Version im Handel erhältlich sein. Für das Spielen von Command & Conquer Alarmstufe Rot 3: Der Aufstand wird das Hauptprogramm nicht benötigt. Command & Conquer Alarmstufe Rot 3: Der Aufstand beinhaltet vier neue Minikampagnen. Drei diese Kampagnen handeln von den Sowjets, den Alliierten und dem Reich der Aufgehenden Sonne. Die vierte Kampagne konzentriert sich vollständig auf Yuriko Omega, dem scheinbar harmlosen japanischen Schulmädchen, das vom Reich der Aufgehenden Sonne zur tödlichen Waffe geschaffen wurde. Der Spieler begleitet Yuriko Omega bei ihrem Ausbruch aus der psychologischen Forschungseinrichtung.