Global Ops: Commando Libya ist ein Story getriebenes, "squad" basiertes Action Game mit aktuellem Bezug auf den Libyen-Konflikt. Der Spieler ist Mitglied eines Spezialteams und muss alleine oder mit computergesteuerten Begleitern eine drohende atomare Katastrophe durch Terroristen verhindern. Die Story beginnt bereits am 21. Januar 1968, als ein B-52G Bomber mit vier thermonuklearen Bomben an Bord im Eismeer der North Star Bay nahe der Thule Airbase abstürzt. Die Suchtrupps können das Wrack und drei der Bomben finden. Die vierte bleibt verschollen. Zurück in der Gegenwart bedeutet das: Der berüchtigte russische Mafiaboss und Waffenhändler Yebievdenko hat ein neues Spielzeug im Angebot: eine Atombombe. Die CIA erfährt von seinen Plänen, sie einem libyschen Machthaber zu verkaufen. Es wird befürchtet, sie soll in einem Terroranschlag gegen die USA eingesetzt werden – aus Rache für die amerikanische Einmischung in den Libyen Konflikt.