Team Rainbow sieht sich einer neuen und sehr realen Bedrohung namens "True Patriots" gegenüber. Dabei handelt es sich um eine voll ausgebildete, organisierte revolutionäre Gruppe, die von der wachsenden Frustration und Wut im modernen Amerika profitiert und sich von gierigen Politikern und Firmen korrumpiert fühlt. Geleitet von einer berechnenden Führungsperson namens Tredway, macht diese einfache und bodenständige Organisation vor nichts halt, um die Regierung und wirtschaftliche Institutionen zu stürzen, mit dem Ziel ihr Land zurückzugewinnen. Durch die Realität des modernen Terrorismus muss sich der Spieler kritischen Szenarien stellen, die ihn vor schwierige moralische Entscheidungen stellen, um diese neue Art von Terroristen zu stoppen. Entwickelt wird das Spiel von Ubisoft Montreal mit Unterstützung von Ubisoft Toronto und Red Storm. Dabei dreht sich "Tom Clancy’s Rainbow 6 Patriots" nicht nur um eine dynamische Einzelspieler-Story, sondern führt auch einen Co-Op- und Multiplayer-Modus ein.